После падения Эона Освоения Акивили его новаторская воля передалась его последователями - Безымянными. Среди всего прочего им достался Звёздный экспресс, на котором он когда-то ездил. Однако Опухоль всех миров безудержно распространялась. Серебряные рельсы, по которым ехал экспресс, так же пострадали. Когда возникла эпидемия, экспресс уже едва мог двигаться, поэтому единственное, что ему оставалось, - это остановиться.
Спустя долгое время заброшенный экспресс нашла рыжеволосая девушка. Её впечатлила его история. Она решила починить изношенные рельсы и восстановить экспресс. Любознательная девушка села в экспресс и отправилась в первопроходческую экспедицию.
Звёздный экспресс следует от станции к станции, пассажиры постоянно садятся в него и сходят. Путешественники приходят из разных миров, у них разное прошлое, и едут они в разные пункты назначения. Но пока они в экспрессе, у них одно путешествие на всех. Хотя у пассажиров есть свои мысли и свои мотивы, экспрессу и Химеко нет до них дела. Двери открыты для всех, кто хочет отправиться в путешествие.